[인천대 생명공학실험1 A＋] DNA ISOLATION, PCR,16S rRNA gene sequencing , phylogenetic tree analysis 실험결과 보고서

1. Abstract

본 연구에서는 인천대학교 생명공학실험1 수업의 일환으로 DNA 분리, PCR(중합효소 연쇄 반응), 16S rRNA 유전자 염기서열 분석 및 계통수 분석을 수행하였다. 실험의 주요 목적은 환경 샘플에서 미생물 군집을 특성화하고 이를 통해 생태학적 다양성을 이해하는 데에 있다. 실험에 사용된 샘플은 특정 환경에서 채취하였으며, DNA 분리는 효소적 방법과 물리적 방법을 활용하여 수행하였다. 추출된 DNA는 적절한 농도로 조절한 후, PCR을 통해 특정 유전자를 증폭하였다. 16S rRNA 유전자는 미생물 분류에 있어 중요한 마커로, 이 유전자의 증폭된 제품을 통해 다양한 미생물 종의 존재 여부를 확인하고, 이들의 유전적 관계를 분석할 수 있었다. PCR 반응 조건은 최적화되어, 특정 온도와 시간 동안 변성, 어닐링, 신장 과정을 반복함으로써 고품질의 PCR 산물을 확보하였다. 이후, 증폭된 PCR 산물은 전기 영동을 통해 확인되었고, 성공적으로 원하는 크기의 밴드를 얻을 수 있었다. 이 밴드는 다음 단계인 염기 서열 분석을 위해 정제되었다. 16S rRNA 유전자의 염기서열은 Sanger 시퀀싱 방법을 통해 결정되었으며, 얻어진 염기서열 데이터는 NCBI BLAST …(생략)